En principio el término agro-ecología se usó para hacer referencia a fenómenos ecológicos como la relación entre las malezas y las plagas y las plantas cultivadas. Posteriormente se le dio una connotación más amplia para referirse a la concepción particular de la actividad agraria más ligada al ambiente y más sostenible socialmente. En sentido restringido se refiere al estudio de fenómenos netamente ecológicos dentro del campo de cultivos como competencia de cultivos/maleza o las relaciones benéficas entre especies vegetales.