En la actualidad muchos ecosistemas naturales han sido intervenidos drásticamente (desforestaciones, labranza inadecuada, uso excesivo de fertilizantes, entre otros) aún sin conocer que procesos estaban ocurriendo en dichas condiciones que pudieran orientar las prácticas de manejo de suelos y cultivos a ser empleados. Rescatar de nuevo las prácticas conservacionistas de nuestros antepasados y mejorarlas con los avances técnicos y el conocimiento de los procesos dinámicos que ocurren en el suelo, hoy se hace necesario y están cada día cobrando interés. Tal vez esto, es consecuencia de los altos costos de los fertilizantes químicos y porque al tratar de obtener grandes producciones y rápidos beneficios económicos al mismo tiempo, no hizo sustentable esos ecosistemas. La contribución de este trabajo, es el de tratar de entender como el manejo que se le da al suelo afecta no sólo los procesos bioquímicos (bastante estudiados en la literatura), sino como estos están relacionados con la actividad de sus comunidades microbianas, que permitan tener un enfoque sistémico y hablar de la efectividad y calidad de las prácticas del manejo aplicado.