La Región de Aysén posee el mayor sistema de Áreas Silvestres Protegidas del país con un tercio del total nacional (de 14,6 millones de ha a nivel nacional y en la región hay más de 5,3 millones de ha), con un enorme potencial de desarrollo turístico. Agregando la superficie de porciones marinas que las unidades insulares poseen, de aproximadamente 1,8 millones de hectáreas, la suma de las porciones terrestres y marinas representa aproximadamente 7,1 millones de hectáreas protegidas por el SNASPE a nivel regional. En la Región de Aysén existen 18 áreas silvestres protegidas estatales, de las cuales 6 son Parques Nacionales, 10 Reservas Nacionales y 2 Monumentos Naturales, que totalizan 5.344.488 ha. De todas ellas, solo diez poseen presencia de CONAF.