Durante el período 1994-2000 nacieron alianzas estratégicas a partir de convenios interinstitucionales, los que se tradujeron en intercambio de información, participación en proyectos y en venta de productos y servicios, yen un importante incremento de las bases de datos de CIREN a un menor costo. Entre las instituciones que conjugaron sus fortalezas con las de CIREN figuran el Ministerio de Agricultura, el Instituto Geográfico Militar, la Oficina de Estudios y Políticas Agrarias, la Corporación Nacional Forestal, el Servicio Aerofotogramétrico de la Fuerza Aérea de Chile, y el Ministerio de Bienes Nacionales.